ถ้ำหลวงสะเกิน ตั้งอยู่ในเขตอุทยานแห่งชาติถ้ำสะเกิน อยู่ในเขต อ.สองแคว ห่างจากตัวเมืองน่าน ประมาณ 120 กม. ตามทางหลวงหมายเลข 1080-1148 มีพื้นที่ 157,812 ไร่ เป็นพื้นที่กำเนิดของสามลุ่มน้ำ คือ ลุ่มน้ำยมตอนบน ลุ่มน้ำยาวตอนบน และลุ่มน้ำลาว ซึ่งเป็นต้นกำเนิดของแม่น้ำน่าน และแม่น้ำยม มียอดเขาสูงที่สุด คือ ดอยจี๋ มีความสูงจากระดับน้ำทะเลปานกลาง 1,572 ม.